工程学院始建于1948年，始称农机系，是学校办学最悠久的教学单位之一，已具有七十多年的办学历史。

　　学院拥有“农业工程”、“机械工程”和“管理科学与工程”3个一级学科（其中，“农业工程”为博士学位授权一级学科点），含“农业机械化工程”、“农业生物环境与能源工程”、“农业系统工程与管理工程”、“机械设计及理论”、“车辆工程”、“系统工程”“工业工程与物流工程”7个二级学科（其中，“农业机械化工程”为国家重点学科）；设有农业工程博士后科研流动站1个。

学院现有8个系（农业机械化工程系、 机械设计及制造工程系、车辆工程系、包装工程系、新能源科学与工程系、农业建筑环境与工程系、工业工程系、物流工程系），1个实验中心（工程实训中心）；设置8个专业，分别为：农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、农业建筑环境与能源工程、工业工程、车辆工程、包装工程、新能源科学与工程、物流工程（其中，国家级一流本科专业2个：农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化，黑龙江省一流本科专业4个：农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、农业建筑环境与能源工程、工业工程），实行按类招生。　　

学院拥有农业农村部高效播种收获装备重点实验室、农业农村部生猪养殖设施工程重点实验室、农业农村部北方一季稻全程机械化科研基地、农业农村部北方马铃薯全程机械化科研基地、黑龙江省北方寒地现代农业装备技术重点实验室、黑龙江省寒地农业可再生资源利用技术与装备重点实验室、黑龙江省主要农作物生产机械化材料化技术创新中心。学院教学科研用房面积18000平方米，拥有相关大型仪器设备2245台（套），总值9900多万元。

　　学院现有教职员工109人，其中入选“神农领军英才”1人、国家产业技术体系岗位科学家3人、香江学者1人、黑龙江省教学名师1人、全国十佳农机教师1人、黑龙江省535领军人才梯队带头人1人、黑龙江省领军人才梯队带头人1人、黑龙江省现代农业产业技术协同创新推广体系首席科学家1人、国务院特殊津贴获得者1人、黑龙江省政府特殊津贴获得者1人、黑龙江省首批“高层次人才”7人（含C类4人、D类3人）、黑龙江省“优秀科技工作者”1人、黑龙江省自然科学基金优秀青年项目获得者5人、黑龙江省新世纪人才1人、黑龙江省高校青年创新人才10人、“黑龙江省青年科技人才托举工程项目”1人。学院现有教授23人、副教授28人、讲师23人，博士生导师27人、硕士生导师28人。学院现有在校博士研究生49人、硕士研究生354人、本科生2000余人。

　　学院近五年来，承担国家重点研发计划项目、国家自然科学基金以及省部级重点等课题共120余项，累计科研经费1.15亿元；获黑龙江省科学技术奖一等奖3项、二等奖2项、三等奖2项，北京市科学技术进步奖一等奖1项；发表SCI和EI论文358篇，授权国家发明专利143项，转化科技成果4项，为行业和地方经济建设提供了有力支撑。

　作为东北农业大学骨干支柱学院和学校唯一曾经拥有院士的学院，工程学院在发扬“艰苦奋斗，自强不息”东农精神的基础上，进一步传承蒋亦元先生“勤于思践，敢于胜利；贵在奇正，重于专律；锲而不舍，韧于成败”的院士精神，坚持“荟一流师资、固一流学科、建一流专业、育一流人才、组一流团队、筑一流平台、施一流管理、呈一流服务、创一流环境、出一流成果”，全方位推进“一流学院”建设。